天麻低海拔代料栽培的管理主要是温、湿度管理，天麻栽培后，生长阶段适宜温度为15℃―25℃之间，最适宜18℃―22℃之间，若高于28℃停止生长，30℃以上死亡，特别是伏天的气温持续高达30℃以上，又遇高湿的情况下，天麻就会烂掉，采挖时就会发现很多腐烂的大天麻。因此，一是要避免太阳暴晒，二是要尽量采取措施降温，最好控制在18℃―22℃之间。湿度对天麻生长也很重要，一般适宜土壤含水量在50%―60%之间，过干、过湿都不利于生长。土壤过湿影响天麻透气容易腐烂，要求保持在播种时的那种土壤湿度。在管理过程中，若发现表土干白时，可浇少量的水，只要保持表土有一定的润度就行了，不要把过多的水浇到土壤中心去。

光照方面管理不很重要，天麻虽然是植物，但它不能进行光合作用，只要不是全黑暗的条件都能生长，但强烈的阳光直射或暴晒造成温度过高，不利于生长。因此必须采取人工荫棚或树林下避光阴凉环境。

通气问题：天麻生长需要一定的空气，无论在室内或室外，任何条件下，都不能用塑料薄膜严密覆盖，栽培和发菌的面积都不能连成一大片，必须在1米宽时留空隙或人行道，以利透气。