灰霉病和疫病是韭菜常发的病害，其防治方法如下：

灰霉病优先选用粉尘剂、烟雾剂，在干燥的晴天也可喷雾。生物农药可选用木霉菌剂（5亿孢子/g）1kg/亩喷雾或枯草芽胞杆菌菌剂（100亿孢子/g）150g/亩喷粉预防。灰霉病发生后，可使用24%井冈霉素+嘧啶核苷1500倍液喷雾。

化学农药可选用6.5%甲霉灵粉尘剂或6.5%万霉灵粉尘剂1kg/亩喷施，7天喷一次。烟雾剂可选用45%百菌清烟雾剂或45%异菌脲烟雾剂（扑海因）120g/亩，分放5～6处，于傍晚点燃，闭棚一夜。喷雾可选用40%嘧霉胺悬浮剂1000倍液，或50%速克灵可湿性粉剂（腐霉利）1000～1500倍液，或50%扑海因可湿性粉剂（异菌脲）1000倍液。收获前2周内禁止使用化学杀菌剂。

疫病可选用生物农药木霉菌剂（5亿孢子/g）1kg/亩喷雾或枯草芽胞杆菌菌剂（100亿孢子/g）150g/亩喷粉预防。

发病前，选用68.75％噁唑锰锌水分散粒剂1000倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或80%代森锰锌可湿性粉剂600倍液喷雾保护。发病初期，可用72%霜脲锰锌可湿性粉剂600倍液，或53.8%甲霜灵锰锌可湿性粉剂600倍液，或52.5%噁酮·霜脲氰水分散性粒剂1500～2000倍液，或72.2%霜霉威水剂600～1000倍液，或10%氟噻唑吡乙酮油悬浮剂1000倍液喷雾防治。注意交替用药。