1、根腐病

多发生在高温、多雨季节，病株叶片逐渐发黄脱落，最后地上部枯萎，根部完全腐烂。防治：注意排水，可用50%多菌灵可湿性粉剂或70%甲基托布津可湿性粉剂800～1000倍液浇穴。

2、紫纹羽病

主要危害根部。病斑初期呈褐色，最后呈紫褐色，并逐渐由外向内腐烂，烂根表面有紫色菌索交织成膜和菌核，地上植株自上而下黄萎，最后整株死亡。防治：发病后拔除病株烧毁，病穴用石灰粉消毒。

3、白粉病

危害叶片及荚果。发病后，叶片两面及荚果表面初生白色粉状斑，随后蔓延呈覆白粉，后期在病斑上出现很多小黑点，造成早期落叶或整枝枯萎。防治：发病初期用波美0.3°石灰硫磺合剂或70%甲基托布津可湿性粉剂800～1000倍液喷施，每2周1次，共喷2～3次。

4、蚜虫

6～8月发生，危害上部嫩梢，影响黄芪生长发育。防治：可用40%乐果乳油800～1500倍液防治。

5、豆荚螟

6月下旬发生。幼虫蛀入豆荚危害种子。防治：于花期用90%敌百虫1000倍或40%乐果乳油800～1500倍液防治。