水稻立枯病在苗期刚发病时即应喷药防治，秧田期一看到发病株或发病中心即应喷药防治，稻田同时喷施护树将军杀菌消毒，减少病菌源。

①首选移栽灵育秧防病：育秧时每平方米用移栽灵1~2毫升兑水3~5公斤，使用时可把底肥一起溶在水中，搅拌均匀，然后将药剂均匀浇在床土上，播上种子并盖土，喷施新高脂膜800倍液可保墒防水分蒸发、防晒抗旱、保温防冻、防土层板结，窒息和隔离病虫源，提高出苗率；在秧苗1~2叶期或发病初期再用一次均匀喷雾即可。

②育秧时每平方米用50%敌克松2克加水3~5公斤在播种前浇泼秧床，在秧苗1~2叶期或发病初期再用一次灌兜，具有防病壮苗双重作用。